A különböző típusú tercier szennyvízkezelési technológiák közül csak az MBR membrántechnológia képes teljes mértékben integrálni a biológiai tisztítás három funkcióját, a szilárd-folyadék elválasztást (másodlagos ülepítő tartály) és a harmadlagos tisztítást. Mivel az MBR membrán szilárd-folyadék elválasztó hatása sokkal jobb, mint a másodlagos ülepítő tartályé (általában az ultraszűrő membrán kilépő SS értéke 0 közelében van), a membránok hatékonyan megtartják a biológiai rendszerben lévő összes baktériumot és makromolekuláris szerves anyagot. A membránmegtartó tulajdonságoknak köszönhetően a lassabb emésztési sebességű baktériumok hosszabb visszatartási idejű iszapban gazdagodnak, ami viszont javíthatja a szerves anyagok, a nitrogén és a foszfor eltávolítási sebességét.